純化水系統(tǒng)的微生物污染分為外源性微生物污染和內(nèi)源性微生物污染。外源性微生物污染主要來自原水，內(nèi)源性微生物污染主要來自單元操作以及分配系統(tǒng)。微生物涵蓋有益和有害的眾多種類，其的生長和存活需要五大條件，包括適宜的營養(yǎng)條件、適量的氧含量、合適的pH值、合適的環(huán)境溫度以及合適的接種量。

    純化水系統(tǒng)中的大部分微生物是以生物膜為形式存在于系統(tǒng)內(nèi)表面，形成不斷的污染源，很難取樣和定量，也很難用一些常規(guī)的方式處理。目前來說，臭氧消毒是應用廣泛且去除生物膜有效的方法。

    純化水系統(tǒng)的微生物負荷發(fā)展的趨勢與細菌生長曲線相關(guān)聯(lián)，包括遲緩期、對數(shù)期、穩(wěn)定器、衰退期四個階段，不同階段的生長繁殖速度和菌群數(shù)量有所區(qū)別。因此，在純化水系統(tǒng)設(shè)計時掌握微生物變化規(guī)律，可以合理確認消毒和殺菌周期。

    純化水系統(tǒng)發(fā)生微生物污染受到多方面因素的影響，主要包括流速、表面粗糙度、死角、坡度、溫度、連接方式等等。對于一些自動化程度不高的純化水系統(tǒng)，人員手動操作是引起污染的重要因素之一。

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